平潭國庫支付改革本著“先行先試、綜合實驗”的特色，著力在“五個化”上下功夫、求深化，即賬戶規范化、管理精細化、會計代理化、服務優質化、監管立體化，開創了國庫管理改革的新局面。特別是做足三道文章，創新三個特色：

　　一是創新會計核算模式。針對平潭會計財務人員短缺的情況，一改傳統的會計集中核算模式，創新設立了區直單位代理結算中心，實行統一賬戶、統一審核、統一支付、統一結算、統一記賬、統一簽訂《委托代理記賬協議書》的“六統一”。這一創新舉措，既解決傳統會計集中核算主體不清、職責不明的問題，又實現了高效便捷、有利監管的目的。

　　二是創新業務流程。按照“抓大放小”、“寬進嚴出”的原則，對收件、辦理、辦結三個環節全面簡化優化，平均整個流程比原有的簡化了30%左右。

　　三是創新管理機制。比如，制定出臺了各項目指揮部參照法人單位財務管理的暫行規定，使指揮部財務管理法人化、規范化，克服了臨時性的傳統觀念；比如，制定了實驗區專項資金管理辦法，實現了各項資金使用的有效監管；比如，實行了“容缺”辦理、直通道辦理的辦法，對應急資金支付、重大項目啟動資金支付予以急事急辦，特事特辦，同時限時補件補辦，確保“先上車超常規，后補票不違規”。