安徽利辛縣農業綜合開發在實施過程中，全面加強組織領導，創新機制，規范管理。規范了規劃設計管理、制度管理、資金管理、檔案管理、項目管理等。

　　在規范規劃設計管理方面，圍繞現代農業示范項目建設標準，本著綜合性、超前性、可行性的原則，對項目區進行統一規劃和科學設計，最大限度地降低了工程成本。

　　在規范制度管理方面，制定了施工管理辦法、工程竣工驗收實施細則、項目責任人考核辦法、工程運行管護辦法，為項目順利實施提供了保障。

　　在規范資金管理方面，制定了財務管理辦法，嚴格實行縣級報賬制。規范了報賬手續和報賬程序，項目資金實行專人、專賬、專戶“三專” 管理，記賬實行“電算化”。確保了項目資金安全有效使用。

　　在項目檔案管理方面，按照省農發局農發項[2006]127號文件要求，制定檔案管理制度，確定專人、專室、專柜管理，堅持檔案管理與項目建設同步進行，按項目計劃、建設、驗收等三大類分卷建檔，確保檔案的完整、準確、系統和規范。

　　在規范項目管理方面，全面推行競爭立項機制，提高項目建設的群眾參與程度，健全了項目招投標制，工程監理制，工程質量負責制，項目驗收制等一系列制度。健全有力的項目管理制度，確保了利辛農業綜合開發項目建設水平和質量始終走在時代的前列。