為實現服務政府投資管理、服務財政預算管理、服務黨政領導決策三大宗旨，財政投資評審中心強化內部建設，實現科學管理。

　　一是堅持人才戰略。在吸納人才、培訓人才、留住人才方面建立長效激勵機制。即嚴格進人標準，操持常態化的人員培訓機制；保持骨干人員的穩定；建立靈活的收入分配政策。

　　二是做到合理分工。按照業務性質，中心下設五個部，即綜合部、工程一部、工程二部、監管部、績效部。其中兩個工程業務部按行業和工程類別分工，監管部在工程部配合下開展財政監管，部門之間既有分工又有合作。

　　三是加強制度建設。建立項目負責人制度、項目聯系人制度、三級復核制度為核心的質量控制體系，從評審人員的勝任能力、獨立性等多個方面保證評審業務質量，完善內部監督制約機制，任何一個人都不能單獨完成一個項目評審的所有工作，從制度上保障了評審業務質量和評審人員的安全。業務質量評定、考勤考核、行政效率督查等制度的嚴格執行也保障了中心的正常運轉。

　　四是堅持民主管理。中心內部管理實行民主集中制，在局黨組領導下實行民主決策、民主管理。一是中心辦公會，成員由中心負責人和各部門負責人組成，主要負責內部管理重大事項的決策；二是專家委員會，成員由具有中級以上專業技術職稱的骨干人員組成，主要負責中心執業標準和業務規范的制定、重大課題研究、評審中疑難問題的會診等。通過民主管理保證了中心各項制度、規范得到有效執行。

　　五是加強信息化建設。通過與成都森克公司合作，開發了評審綜合管理系統，建立了中心局域網，致力于提高財政投資評審效率、質量和透明度，加強評審工作的監管監督，減少評審中的人為失誤，實現財政投資評審過程數據的信息化。