根據自治區的統一部署，伊犁州在充分調查研究，科學論證的基礎上，編制完成了符合州直實際，全面反映今后一段時期農業綜合開發工作思路、重點和措施的《伊犁州農業綜合開發“十二五”規劃》，并報州農業綜合開發領導小組和自治區農發辦審定。在規劃編制過程中，結合州直縣市經濟、社會、資源狀況,從灌排設施配套、農田平整肥沃、田間道路暢通、農田林網健全、生產方式先進、產出效益較高六個方面，進一步細化量化高標準農田以及伊犁河谷農業綜合開發建設要求。同時，注重把握四個原則：一是堅持服務現代高效農業發展的原則；二是堅持集中連片規模開發的原則；三是堅持加強農田基礎設施建設的原則；四是堅持整合資源、集聚投入的原則。

　　“十二五”期間，伊犁州直將規劃建設高標準農田31萬畝、改造中低產田54.7萬畝、實施生態綜合治理7.5萬畝、規劃實施中型灌區節水配套改造項目7個、建設農業綜合開發產業化經營財政補助項目92個、規劃農業綜合開發中央財政貸款貼息項目89個，項目計劃總投資165169.96萬元，其中中央財政資金82776萬元，地方財政配套33110.4萬元（其中區級27109.4萬元，州級3311.04萬元，縣級2689.96萬元），農民及項目單位自籌資金4469.3萬元，其他資金（水利部門配套資金）4604.26萬元。

　　到“十二五”末，農業綜合開發項目新增灌溉面積18.5萬畝，改善灌溉面積139.72萬畝，新增節水灌溉面積114.04萬畝，并通過林業措施增加農田林網防護面積44.24萬畝，擴大良種種植面積30.36萬畝，治理沙化土地面積5萬畝。項目區新增種植業總產值26819.76萬元，新增農村勞動力就業人數達到2107人。