隨著國家對醫療的投入力度不斷加大，援疆對口幫扶措施的落實，尼勒克縣的醫療衛生事業也取得了長足進步。

　　自2006年起，尼勒克縣不斷加大對醫療衛生設施的投入，出資1800萬元實施了縣醫院整體搬遷工程，投入1300萬元建設了疾控中心業務樓、縣醫院傳染病房、急診樓并實施了11個鄉鎮衛生院門診樓建設項目。今年，尼勒克縣又爭取到各類衛生項目5項，總投資達283萬元，使全縣的醫療體系日益完善，為尼勒克縣的各族群眾提供了醫療保障。

　　近幾年，該縣充分利用國家項目資金，在硬件、軟件兩個方面下大力氣，進一步改善了農牧民群眾就醫條件，軟件方面，一方面加大對在職醫務人員的培訓，提高醫務人員醫技水平，另一方面通過對口支援，提升醫療服務水平，縣級醫療機構對鄉鎮衛生院也進行對口支援，提高基層技術人員醫療水平，確保農牧民及時就醫。