一是建立部門間協調的管理機制。成立財政支農資金整合試點工作協調領導小組，組長由縣委副書記、縣長擔任，副組長由縣委常委、常務副縣長，縣委常委、農辦主任擔任，成員由相關部門組成，協調解決支農資金整合中出現的矛盾和問題。

　　二是建立統一項目庫、統一項目申報。為整合資金工作的順利開展，各部門首先將項目報送支農資金整合工作領導小組項目辦公室，建立涵蓋重點領域的項目庫，統籌規劃項目。支農資金整合工作領導小組項目辦公室把項目庫中的項目進行分類，各項目單位申報項目時，直接從項目庫中抽取項目，并經過發改委的審批后，從項目庫分類項目中提取項目申報，以項目規劃帶動資金的集中使用，確保各部門項目審批后項目資金的整合。

　　三是建立資金管理新機制。一是性質不變，確保支農資金全部用在農村的建設發展上，不截留、不挪用，縣級財政給予配套。二是用途不變，支農資金整合前屬于何種用途，就投向什么領域，如產業發展、基礎設施建設、社會事業等，整合后不改變資金投向。三是主管部門不變，整合資金既不是政府集權，也不是財政爭權，仍堅持“誰主管、誰負責”，各職能部門相互配合，各司其職，各負其責，確保支農資金整合工作落到實處。四是檢查驗收標準不變，始終堅持自治區制定的政策，嚴格按程序組織項目竣工驗收，不擅自改變或降低標準，同時由財政、農業、審計、監察等部門進行核查，評估資金使用績效，堅決杜絕跑冒滴漏，從而使資金的管理更加規范透明，資金到位率和節約率得到了全面提高。

　　四是建立長效機制。長期堅持整合資金的運行模式，建立項目的投資政策導向機制，減少重復投資、避免交叉投入，逐步形成支農資金項目科學、安排規范、使用高效、運行安全的使用管理機制。