企業(yè)在計算并申報所得稅時，可以依據(jù)國家稅務(wù)總局發(fā)布的《企業(yè)所得稅法實施條例》中的規(guī)定，按照以下步驟計算和申報所得稅中的三項經(jīng)費扣除：
1. 確定應(yīng)納稅所得額：應(yīng)納稅所得額=全年應(yīng)納稅收入總額-全年可扣除費用總額-非稅收入總額。
2. 計算三項經(jīng)費扣除：企業(yè)可以根據(jù)自己的情況，在應(yīng)納稅所得額的基礎(chǔ)上，按照規(guī)定的比例計算三項經(jīng)費扣除。其中，研究開發(fā)費用扣除比例為50%，技術(shù)轉(zhuǎn)讓費用扣除比例為80%，職工教育經(jīng)費扣除比例為2.5%。
3. 減免稅額：企業(yè)可以根據(jù)自己的情況，申請享受各種減免稅政策，如小型微利企業(yè)所得稅優(yōu)惠等。減免稅額=應(yīng)納稅所得額×減免稅率。
4. 最終所得稅額：最終所得稅額=應(yīng)納稅所得額×稅率-減免稅額。

在申報所得稅時，企業(yè)需要填寫《企業(yè)所得稅年度納稅申報表》和相關(guān)附表，并按規(guī)定提交各種證明材料和憑證。同時，企業(yè)還需要按照規(guī)定的時間和方式繳納所得稅。