環境保護稅是一種稅收，應當按照稅法的規定計入企業的成本和費用中。根據財務會計準則，環境保護稅的會計科目主要包括以下幾個方面：
1. 環境保護稅應納稅額：這是環境保護稅的應納稅額，應當按照稅法規定計入企業的成本和費用中。
2. 環境保護稅繳納：這是企業繳納環境保護稅的費用，應當計入企業的財務費用中。
3. 環境保護稅減免：企業可以享受環境保護稅的減免政策，減免金額應當計入企業的其他收入中。
4. 環境保護投入：企業為了達到環境保護要求而進行的投入，包括環保設施建設、環保設備購置、環保技術研發等，應當計入企業的固定資產和研發費用中。

需要注意的是，不同企業的具體會計科目可能會有所不同，具體應當根據企業的實際情況進行設置。