在進行主營業務稅金及附加的會計分錄時，需要注意以下會計核算原則：
1. 會計核算的實質與經濟實質一致原則：主營業務稅金及附加是企業在從事主營業務活動中所需要繳納的稅費，應當按照其實質進行會計核算。
2. 會計核算的貨幣計量原則：主營業務稅金及附加應當按照實際繳納的金額進行會計核算。
3. 會計核算的成本原則：主營業務稅金及附加應當按照與主營業務相關的成本進行會計核算。
4. 會計核算的獨立性原則：主營業務稅金及附加應當單獨核算，不得與其他費用混淆。
5. 會計核算的實現制原則：主營業務稅金及附加應當按照實際繳納的時間進行會計核算。

總之，在進行主營業務稅金及附加的會計分錄時，需要遵循以上會計核算原則，確保會計核算的準確性和合規性。