耕地占用稅是指在城市建設、工業用地、交通運輸、水利等建設中占用農用地所征收的稅費。其征收方式主要有以下幾種：
1. 按照土地面積征收：即按照占用的耕地面積計算征收稅費，通常是按照每畝土地征收一定的稅費。
2. 按照土地評估價值征收：即按照土地評估價值的一定比例征收稅費，這種方式需要對占用的土地進行評估，以確定其價值。
3. 按照土地使用年限征收：即按照占用的土地使用年限計算征收稅費，通常是按照每年征收一定的稅費。
4. 綜合征收方式：即綜合考慮占用的土地面積、評估價值和使用年限等因素，按照一定的比例計算征收稅費。

需要注意的是，不同地區或不同情況下，耕地占用稅的征收方式可能會有所不同。