根據《中華人民共和國土地增值稅法》的規定，納稅人在計算土地增值稅時，可以扣除土地增值稅的下列支出：
1. 取得土地的費用；
2. 建筑物和構筑物的費用；
3. 土地使用權出讓金；
4. 土地整理費；
5. 城市基礎設施配套費；
6. 其他與土地增值有關的合理支出。

因此，如果納稅人要申請土地增值稅的扣除，需要提供相關的證明材料，如土地購買合同、建筑物和構筑物的發票、土地使用權出讓合同、土地整理費用發票等。這些證明材料可以證明納稅人所扣除的支出是與土地增值有關的合理支出。

需要注意的是，納稅人在申請土地增值稅扣除時，應當依法如實申報，并提供真實、準確、完整的證明材料，否則將承擔相應的法律責任。