增值稅稅收優惠的申請流程一般如下：
1. 先進行申請前的準備工作，包括準備好相關的申請材料，比如企業營業執照、稅務登記證、財務報表等。
2. 將申請材料提交給所在地稅務局，填寫相關的申請表格并進行簽字蓋章。
3. 稅務局進行初審，審核申請材料是否齊全、符合規定等。
4. 如果初審通過，稅務局會進行現場核查，檢查企業的生產經營情況、財務狀況等。
5. 核查通過后，稅務局會對企業進行稅收優惠的批準，并出具相關的證明文件。
6. 企業持證明文件到稅務局領取稅收優惠的相關稅務憑證。

需要注意的是，不同地區的申請流程可能會有所不同，具體還需根據當地的相關規定進行操作。