財政撥款結余是指企業在接受財政撥款后，未使用或未全部使用的資金余額。在企業內部控制中，財政撥款結余的核算是非常重要的，其作用主要有以下幾點：
1. 控制資金使用：財政撥款結余的核算可以幫助企業控制資金的使用，確保資金的合理利用，避免浪費和濫用。
2. 防止挪用：財政撥款結余的核算可以及時發現資金的挪用行為，防止企業內部的不當行為和違法行為。
3. 提高透明度：財政撥款結余的核算可以提高企業的財務透明度，讓相關方了解企業的財務狀況和資金使用情況，增強企業的信譽度。
4. 合規管理：財政撥款結余的核算可以幫助企業遵守相關法規和規定，實現合規管理，避免因違規行為而受到處罰。

因此，財政撥款結余的核算在企業內部控制中起著非常重要的作用，有助于提高企業的管理水平和財務狀況。