小規(guī)模納稅人增值稅的稅款繳納方式有兩種：
1.按照銷售額的百分之三繳納固定比例稅款。小規(guī)模納稅人可以在每個(gè)納稅期內(nèi)按照銷售額的百分之三繳納增值稅，不需要計(jì)算銷項(xiàng)稅額和進(jìn)項(xiàng)稅額。
2.按照銷項(xiàng)稅額與進(jìn)項(xiàng)稅額的差額繳納稅款。小規(guī)模納稅人也可以選擇按照銷項(xiàng)稅額與進(jìn)項(xiàng)稅額的差額計(jì)算稅款并進(jìn)行繳納。具體計(jì)算方法為：銷項(xiàng)稅額-進(jìn)項(xiàng)稅額=應(yīng)納稅額，應(yīng)納稅額*3%=應(yīng)繳納的增值稅稅款。

需要注意的是，小規(guī)模納稅人選擇哪種繳稅方式需要在注冊時(shí)進(jìn)行選擇，并且在一年內(nèi)不能更改。同時(shí)，如果銷售額超過規(guī)定的限額，小規(guī)模納稅人需要轉(zhuǎn)為一般納稅人，按照一般納稅人的稅率進(jìn)行繳稅。