在委托加工物資的成本計算中，如果存在工序損耗，應該按照以下步驟處理：
1. 首先確定加工損耗率，即原材料加工后的損耗率。
2. 計算出加工損耗量，即原材料數量乘以加工損耗率。
3. 將加工損耗量分攤到產品的成本中，即將加工損耗量按照產品的生產量分攤到每個產品的成本中。
4. 最后將每個產品的成本加上加工費用，即為最終的成本。

例如，假設原材料數量為1000公斤，加工損耗率為5%，生產出的產品數量為900公斤，加工費用為1000元。則加工損耗量為50公斤（1000公斤 x 5%），每個產品的成本為（1000元+50公斤/900公斤）= 105.56元。