預算單位零余額賬戶的資金來源主要包括以下幾個方面：
1. 預算撥款：預算撥款是指政府按照年度預算法規定，向各級預算單位撥付的資金。預算撥款是預算單位零余額賬戶的主要資金來源之一。
2. 資金收入：預算單位可能會通過各種途徑收入資金，如稅收、收費、罰款等。這些資金也可以成為預算單位零余額賬戶的資金來源。
3. 借款：在資金不足的情況下，預算單位可以通過向銀行等金融機構借款來解決資金缺口。借款所得的資金也可以成為預算單位零余額賬戶的資金來源。
4. 其他資金：預算單位還可能通過其他途徑獲得資金，如政府補助、捐贈等。這些資金也可以成為預算單位零余額賬戶的資金來源。