總分類賬和明細分類賬的平行登記是會計核算中一種常見的賬簿處理方式，但是它也存在一些弊端，主要包括以下幾點：
1. 容易出現錯誤：由于總分類賬和明細分類賬需要同時進行平行登記，而且兩個賬簿之間的數據需要保持一致，因此在操作過程中容易出現錯誤，例如漏記、錯記等。
2. 增加工作量：總分類賬和明細分類賬需要同時進行平行登記，這就需要會計人員花費更多的時間和精力來完成這項工作，尤其是在數據量較大的情況下，工作量會更加繁重。
3. 不利于分析決策：總分類賬和明細分類賬是兩個不同的賬簿，它們的數據處理方式也不同，因此在進行分析決策時，需要將兩個賬簿的數據進行整合，這會增加分析的難度和復雜度。
4. 不便于查錯：如果總分類賬和明細分類賬之間出現了數據不一致的情況，需要進行查錯和調整，這會增加會計人員的工作難度和時間成本。

因此，總體來說，總分類賬和明細分類賬的平行登記雖然是一種常見的賬簿處理方式，但是其弊端也需要引起會計人員的重視。